Численное моделирование пространственных конфигураций ряда аминокислот путём решения уравнения Шрёдингера

Применён численный метод решения уравнения Шрёдингера, предложенный К. Э. Плохотниковым, для расчёта пространственных конфигураций одиннадцати протеиногенных аминокислот (глицин, аланин, валин, лейцин, изолейцин, пролин, серин, треонин, цистеин, тирозин, триптофан) в их канонических геометриях из базы PubChem. Метод сочетает стохастическую дискретизацию конфигурационного пространства по схеме Монте-Карло и конечно-разностную аппроксимацию оператора кинетической энергии. Использована схема позиционирования валентных электронов с делокализацией вдоль ковалентных связей и фиксированным числом валентных электронов по номеру группы таблицы Менделеева. Для всех 11 структур получено относительное отклонение собственного значения Ω_I дискретного гамильтониана от опорной оценки полной энергии E_ref менее 0,02 %, причём Ω_I во всех случаях располагается в средней части спектра. Подробно разобран пример триптофана как наиболее сложной структуры (135 квантовых частиц, размерность конфигурационного пространства 405).